Les champignons, les bactéries et les levures sont des micro-organismes extrêmement répandus dans le sol. Bien que leur nombre varie considérablement d'un environnement à l'autre, on les retrouve dans pratiquement tous les sols du monde. Ces organismes jouent un rôle essentiel dans le maintien de la santé des plantes : tant que leurs populations restent contrôlées, ils sont bien plus utiles que nuisibles. Leur identification peut toutefois s'avérer délicate et nécessite souvent une bonne maîtrise du microscope ainsi que des techniques de préparation de lames.
Symptômes courants d'une infestation
Lorsque le sol est envahi par des champignons, des bactéries ou des levures, les symptômes apparaissent rapidement sur les plantes. La santé générale se dégrade, les feuilles jaunissent ou brunissent, et les branches ou les tiges dépérissent progressivement. Les jardiniers doivent redoubler de vigilance pendant les périodes de pluies prolongées ou d'humidité élevée, car ces conditions favorisent idéalement la prolifération fongique et bactérienne. Les effets sur les végétaux varient selon l'espèce en cause et la gravité de l'infection. Un traitement fongicide ciblé est généralement nécessaire pour enrayer le problème.
Identification des levures
La levure est un type de champignon comptant environ 1 500 espèces, présent dans la plupart des milieux et très commun dans le sol. Elle participe à la décomposition de la matière organique, facilitant ainsi l'alimentation des plantes. Dépourvue de chlorophylle, elle se reproduit par bourgeonnement.
L'identification des levures s'effectue généralement par coloration de Gram, un procédé qui consiste à préparer une lame puis à colorer l'échantillon avec des solutions de violet cristal et de safranine. Correctement réalisée, cette technique révèle des cellules isolées ou en bourgeonnement, parfois disposées en chaînes appelées pseudohyphes. Les cellules de levure sont gram positives : elles apparaissent en bleu foncé et peuvent être jusqu'à quatre fois plus grandes que les bactéries.
Identification des bactéries
L'identification précise des types de bactéries peut être indispensable pour traiter efficacement une infestation. Certaines, comme les fumagines ou certains flétrissements, se reconnaissent facilement grâce aux signes caractéristiques qu'elles laissent sur les parties aériennes de la plante. D'autres, comme le pourridié (pourriture des racines), transforment les racines en une substance grise et molle, devenue incapable de transporter l'eau ou les nutriments.
Pour les autres, la culture d'un échantillon dans une boîte de Petri contenant une solution gélosée facilite grandement l'identification : la couleur, la forme et le mode de croissance permettent de déterminer l'espèce. Les membres de la famille des Rhizobiaceae figurent parmi les bactéries les plus communes et les plus répandues au monde. Elles se présentent sous plusieurs couleurs, ne sont généralement pas nocives pour l'écosystème du sol et sont particulièrement bénéfiques aux légumineuses.
Identification des champignons
Les champignons se distinguent généralement des bactéries et des levures par leur structure : ils poussent souvent en longs filaments appelés hyphes, capables de s'étendre sur de très petites comme de très grandes distances. On distingue trois grands groupes de champignons, dont un seul est nuisible.
Les champignons saprophytes sont des décomposeurs qui transforment la matière organique en éléments assimilables par les plantes, tandis que les champignons mycorhiziens colonisent les racines sans être parasites : dans cette relation symbiotique, la plante et le champignon tirent tous deux profit de l'association, le champignon convertissant généralement les minéraux sous des formes utilisables. Enfin, les champignons pathogènes, tels que le verticillium, le pythium et le rhizoctonia, se traitent chacun au moyen d'un fongicide et peuvent entraîner la mort de la plante s'ils ne sont pas pris en charge. L'identification s'effectue de manière similaire à celle des bactéries : on prélève un échantillon et on le laisse se développer sur une solution gélosée dans une boîte de Petri.
Source : https://jardin.98905.com/garden-lawn/soil/1007049428.html