La maladie de Lyme est une affection causée par la bactérie Borrelia burgdorferi, un pathogène transmis par les tiques à pattes noires. Comme pour de nombreux autres agents pathogènes, les biologistes ont pu retracer une partie de l'histoire évolutive de B. burgdorferi grâce à l'analyse génétique. Un arbre phylogénétique d'une bactérie telle que B. burgdorferi offre une illustration visuelle de ses relations avec d'autres souches et espèces.
Les arbres phylogénétiques
Un arbre phylogénétique illustre les relations évolutives entre différentes espèces. Chaque « nœud » de l'arbre représente l'émergence d'une nouvelle espèce : si deux espèces peuvent remonter leur lignée jusqu'à un même nœud, ce dernier correspond au point le plus récent dans le temps où ces deux espèces partageaient un ancêtre commun.
Ces arbres sont construits à partir de caractéristiques physiques et génétiques. Il convient de noter que les biologistes de l'évolution sont souvent contraints de les modifier lorsque de nouvelles données voient le jour.
Le genre Borrelia
Borrelia est en réalité un genre de bactéries qui comprend plusieurs espèces. Le nombre d'espèces de Borrelia a augmenté à plusieurs reprises au cours des deux dernières décennies, à mesure que de nouvelles souches étaient identifiées.
Définir les espèces du genre Borrelia, ou de tout autre genre bactérien, constitue un problème particulièrement délicat. Pour les plantes et les animaux, les biologistes ont traditionnellement défini les espèces selon leur incapacité à se reproduire entre elles et à produire une descendance fertile. Un cheval et un âne peuvent par exemple s'accoupler, mais le mulet qui en résulte est stérile : chevaux et ânes constituent donc des espèces distinctes.
Les bactéries, en revanche, se reproduisent de manière asexuée, ce qui rend cette définition inapplicable. Par conséquent, pour Borrelia comme pour beaucoup d'autres bactéries, les microbiologistes distinguent les espèces grâce à une technique appelée hybridation ADN-ADN globale.
L'établissement des relations entre espèces
Les scientifiques ont construit des arbres phylogénétiques pour les espèces de Borrelia en s'appuyant sur une technique nommée analyse de séquences multilocus (MLSA), qui examine les différences entre des gènes « d'entretien » spécifiques présents chez toutes les espèces. Les biologistes utilisent ensuite un logiciel pour construire « l'arbre le plus parcimonieux », c'est-à-dire l'arbre phylogénétique qui nécessite le plus petit nombre de changements évolutifs pour expliquer les différences observées.
Toutefois, les résultats obtenus par cette méthode doivent souvent être affinés lorsque de nouvelles informations deviennent disponibles.
Les relations actuelles entre les espèces de Borrelia
À l'heure actuelle, B. burgdorferi sensu stricto partage son ancêtre commun le plus récent avec B. bissettii ; ces deux espèces partagent elles-mêmes un ancêtre commun avec B. lusitaniae. Ces trois espèces ont divergé d'un ancêtre commun qu'elles partagent avec B. afzelii, B. spielmanii, B. garinii et B. bavariensis. Ce groupe d'espèces a ensuite divergé d'un ancêtre commun partagé avec B. valaisiana.
Il est important de souligner que cet arbre phylogénétique pourrait très bien évoluer à l'avenir, à mesure que de nouvelles données seront mises au jour. En particulier, il est fort probable que la baisse du coût du séquençage du génome modifie la manière dont les arbres phylogénétiques sont élaborés pour des bactéries telles que B. burgdorferi.
Source : https://jardin.98905.com/home-safety/general-home-safety/1007081382.html